El Enfoque Bayesiano en las Ciencias de la Salud / The Bayesian Approach in the Health Sciences

En estadística existen dos enfoques básicos, la estadística frecuentista que es la corriente principal y la estadística bayesiana. La mayoría de los principales métodos estadísticos son frecuentistas siendo el enfoque bayesiano más desconocido entre los investigadores. En el presente artículo se exponen los fundamentos lógicos del enfoque bayesiano y su uso mediante un ejemplo de aplicación. En este contexto, más que presentar un debate entre la lógica clásica y la bayesiana, se pretende mostrar de manera introductoria las enormes posibilidades que el enfoque bayesiano puede aportar a la investigación en las Ciencias de la Salud.

In the stadistic field there are two basic approaches, the Frequentist Statistics which is the primary one, and the Bayesian Statistics. The most used statistical methods are the Frequentist methods, being the Bayesian approach the most popular among researchers. In this article, the logical basis of the Bayendian approach and its use are exposed through an application example. In this context, rather than presenting a debate between the classic and the Bayensian logic, it is intended to demonstrate in an introductory method the considerable possibilities how Bayesian approach can contribute to Health and Sciences research.

Genotype by environment interactions for body weight in Mediterranean buffaloes using reaction norm models / Interacción genotipo × ambiente para peso corporal de búfalos Mediterráneos utilizando modelos de norma de reacción / Interação genótipo × ambiente para peso corporal de búfalos Mediterrâneos utilizando modelos de norma de reação

Abstract Background: Buffalo breeding has significantly increased in Brazil over recent years. However, few genetic evaluations have been conducted. Objective: To assess Genotype x Environment Interactions in the Mediterranean Water Buffalo in Brazil, for weight at 205 days of age, using reaction norm models via random regression. Methods: Data for buffaloes born between 1990 and 2014 were collected from five farms ascribed to the Brazilian Buffaloe Improvement Program, located in the North (1), Northeast (1), South (2) and Southeast (1) regions of Brazil. The initial database consisted of 5,280 observations at 205 days of age (W205). We assessed fit using two hierarchical reaction norm models: a two-step (HRNM2s) and a one-step (HRNM1s). Model fit was estimated using the Deviance Information Criterion, Deviance Based on Bayes Factors and Deviance based on Conditional Predictive Ordinate. The environmental descriptors were created to group individuals into common production environments based on year, season, herd and sex. Results: The best fit was obtained for the hierarchical reaction norm model with one-step (HRNM1s). Direct heritability estimates for this model ranged from 0.17 to 0.67 and the maternal heritability from 0.02 to 0.11 with increasing environmental gradient. Lower correlations among the sire classifications were obtained in comparison with HRNM1s in environments with low and high management, confirming the presence of genotype x environment interactions. Conclusion: We recommend a wider application of genetic evaluation in buffalo aimed at identifying optimal genotypes within specific environments.

Resumen Antecedentes: La cría de búfalos ha aumentado significativamente en Brasil en los últimos años. Sin embargo, se han realizado escasas evaluaciones genéticas. Objetivo: Evaluar las interacciones genotipo x ambiente en búfalos de agua Mediterráneos criados en Brasil, para peso a los 205 días de edad, utilizando modelos de reacción mediante regresión aleatoria. Métodos: Los datos de búfalos nacidos entre 1990 y 2014 se obtuvieron de cinco granjas situadas en el Norte (1), Nordeste (1), Sur (2) y del Sureste (1) de Brasil. Todas estas haciendas participan en el Programa Brasileño de Mejoramiento de Búfalos. Nuestra base de datos inicial consistió de 5.280 observaciones a los 205 días de edad (P205). Evaluamos el ajuste utilizando dos modelos de norma de reacción jerárquica: de dos pasos (HRNM2s) y un paso (HRNM1s). El ajuste del modelo se estimó usando el Criterio de información de la desviación, desviación basado en los factores de bayes y desviación basado en la ordenación predictiva condicional. Los descriptores ambientales fueron creados para agrupar individuos en ambientes de producción comunes basados en año, estación, rebaño y sexo. Resultados: El mejor ajuste se obtuvo para el modelo de norma de reacción jerárquica con un paso (HRNM1s). Las estimaciones de heredabilidad directa para este modelo variaron de 0,17 a 0,67 y la heredabilidad materna de 0,02 a 0,11 con gradiente ambiental creciente. Las correlaciones más bajas entre las clasificaciones de los reproductores se obtuvieron en comparación con las HRNM1s, en ambientes con bajo y alto manejo, confirmando la presencia de interacciones genotipo x ambiente. Conclusiones: Recomendamos la aplicación amplia de la evaluación genética en búfalos para identificar genotipos óptimos en ambientes específicos.

Resumo Antecedentes: A criação de búfalos aumentou significativamente no Brasil nos últimos anos. No entanto, eles raramente foram objeto de avaliações genéticas. Objetivo: Avaliar as interações genótipo x ambiente em búfalo Mediterrâneo criados no Brasil, para peso aos 205 dias de idade, utilizando modelos de reação por meio de regressão aleatória. Métodos: Os dados para búfalos de água do Mediterrâneo nascidos entre 1990 e 2014 foram coletados de cinco fazendas localizadas nas regiões Norte (1), Nordeste (1), Sul (2) e Sudeste (1) do Brasil. Todas essas fazendas participam do Programa Brasileiro de Melhoramento dos Búfalos. Nosso banco de dados inicial consistiu de 5.280 observações aos 205 dias de idade (P205). Nós avaliamos o ajuste usando dois modelos de norma de reação hierárquica: um de dois passos (HRNM2s) e um passo (HRNM1s). O ajuste do modelo foi estimado usando o Critério de informações do desvio, desvio baseado nos fatores de bayes e desvio baseado na ordenação preditiva condicional. Os descritores ambientais foram criados para agrupar indivíduos em ambientes de produção comuns baseados em ano, estação, rebanho e sexo. Resultados: O melhor ajuste foi obtido para o modelo de norma de reação hierárquica com um passo (HRNM1s). As estimativas de herdabilidade direta para este modelo variaram de 0,17 a 0,67 e a herdabilidade materna de 0,02 a 0,11 com gradiente ambiental crescente. As correlações mais baixas entre as classificações dos reprodutores foram obtidas em comparação com as HRNM1s, em ambientes com baixo e alto manejo, confirmando a presença de interações genótipo x ambiente. Conclusões: Recomendamos a aplicação mais ampla da avaliação genética em búfalos visando identificar genótipos ótimos em ambientes específicos.

Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats / Parámetros genéticos para las características de la canal y del cuerpo evaluadas por ultrasonido en cabras Anglo-Nubianas / Parâmetros genéticos para características da carcaça avaliadas por ultrassom e corporais em caprinos Anglo-Nubianos

Abstract Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in Anglo- Nubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs.

Resumen Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina.

Resumo Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina.

Como o desmatamento influencia a ocorrência de leishmaniose visceral? Uma abordagem contrafactual / How deforestation influence tha occurrence of Visceral Leishmaniasis? A counterfactual approach

A leishmaniose visceral (LV) é uma doença sistêmica de transmissão vetorial. No Brasil, ela é causada pelo protozoário Leishmania infantum e é transmitida por flebotomíneos do gênero Lutzomyia, tendo os cães como a principal fonte de infecção em áreas urbanas. Historicamente a LV era conhecida como uma doença endêmica rural, porém desde a década de 1980, ela atingiu proporções endêmicas e epidêmicas em grandes cidades brasileiras. Desde então vários fatores são considerados como norteadores da expansão da LV, como variáveis socioeconômicas, climáticas e ambientais. Mais especificamente sobre o efeito do desmatamento e perturbações antrópicas no ambiente, a maioria do que se encontra na literatura tem natureza qualitativa ou utiliza de abordagens reducionistas, sem considerar a complexidade da dinâmica de uma doença infecciosa de transmissão vetorial e de caráter zoonóticos. Na presente dissertação, investigamos o efeito do desmatamento na ocorrência de Lutzomyia longipalpis (Lu. longipalpis), leishmaniose visceral canina (LVC) e leishmaniose visceral humana (LVH), tomando como exemplo o estado de São Paulo. Para isso, utilizamos uma abordagem contrafactual para estimar os efeitos (geral, direto e indireto) do desmatamento na ocorrência do Lu. longipalpis/LVC/LVH. Isso foi feito em dois passos, primeiro estimamos os parâmetros por meio de um algoritmo de Metropolis-Hastings duplo e, por fim, estimamos os efeitos causais através de um amostrador de Gibbs, por meio do pacote autognet no R.Vimos que municípios desmatados apresentam 2.63, 2.07 e 3.18 maiores chances de apresentar o vetor, LVC e LVH, respectivamente quando comparados com os municípios que não apresentaram desmatamento. Foi observada também uma forte influência da presença do vetor, LVC e LVH dos municípios vizinhos na ocorrência dos mesmos em municípios previamente livres dos desfechos (6.67, 4.26 e 4.27). Já sob mudanças hipotéticas de prevalência do desmatamento de 50% para 0% no estado, são esperadas quedas na prevalência do vetor, LVC e LVH de 11%, 6.67% e 29.87% respectivamente. O desmatamento influi na ocorrência do vetor, doença em cães e humanos por duas principais vias, (i) alterando o funcionamento do ecossistema e estrutura da comunidade, permitindo a reprodução e colonização do vetor; e (ii) promovendo uma aproximação entre todos os componentes do ciclo da LV. De tal modo, para correto controle da LV e doenças infecciosas como um todo, é imprescindível um desenvolvimento ecologicamente correto com soluções viáveis para as compensações entre a agricultura, urbanização e conservação. urbanização e conservação.

Visceral leishmaniasis (VL) is a systemic vector-borne disease. In Brazil, it caused by the protozoan Leishmania infantum and is transmitted by sandflies of the genus Lutzomyia, with dogs as the principal source of infection in urban areas. Historically, VL was known as a rural endemic disease, since the 80's it has become endemic and epidemic in large Brazilian cities. Since then, many factors were hypothesised as driving VL expansion, as socioeconomic, climatic and environmental variables. More specifically, concerning deforestation and human-made actions in the environment, most studies tend to be qualitative in nature or use traditional reductionist approaches, ignoring the complexities that are inherent of vector-borne zoonotic infectious diseases. The present study aimed to investigate the effect of deforestation in the occurrence of Lutzomyia longipalpis, canine visceral leishmaniasis (CVL), and human visceral leishmaniasis (HVL), taking as a motivating example the São Paulo state (Brazil). To this end, we chose a counterfactual approach to estimate the effects (overall, direct and indirect) of deforestation in the occurrence of vector/CVL/HVL. We did it in two steps; first, we estimated the parameters through a double Metropolis-Hastings algorithm and, finally, we estimated the causal effects through a Gibbs sampler, using the autognet package in R. We observe that deforested cities show 2.63, 2.07, and 3.18 higher odds of vector/CVL/HVL occurrence, respectively, when compared to non-deforested municipalities. We also see a significant influence of vector, CVL, and HVL presence in the neighbours in its appearance in previous naive cities, 6.67, 4.26, 4,27 respectively. Lastly, under hypothetical changes in deforestation's prevalence from 50% to 0% in the whole state, is expected a decrease in its prevalence of the vector, LVC and LVH of 11%, 6.67% and 29.87% respectively. Deforestation in the occurrence of infectious diseases and, more specifically, VL importance, is two-folded: (i) changing's the ecosystem equilibrium and community structure, allowing its vector to reproduce and colonise; (ii) promoting a close contact through the VL cycle components. In such a way, for correct control of VL and infectious disease as a whole, it is essential an eco-friendly development with viable solutions for trade-offs between agriculture, urbanization and conservation.

Carga financiera del cuidado familiar del enfermo crónico en la Región Andina de Colombia / The Financial Burden of Family Care of the Chronically Ill in the Colombian Andean Region / Carga financeira do cuidado familiar do doente crónico na região andina da Colômbia

Introducción Describir y analizar la carga financiera del cuidado familiar del enfermo crónico en la Región Andina de Colombia. Materiales y métodos: Estudio que hace parte del 'Programa para la disminución de la carga de la enfermedad crónica en Colombia'. Su muestra la constituyeron 92 familias que residen en la región Andina de Colombia. Se emplearon los instrumentos "GCPC-UN- D", para caracterizar a los sujetos y la Encuesta "Costo financiero del cuidado de la Enfermedad crónica", para conocer el consumo real efectivo familiar. La Carga financiera atribuible al cuidado familiar se determinó bajo la metodología Caracol. Resultados: Los costos que más agobian a las familias de la Región Andina colombiana son, en su orden, los de salud, transporte, vivienda, alimentación y comunicaciones. El consumo real efectivo familiar se modifica al cuidar a una persona con enfermedad crónica. Discusión: Las familias colombianas que residen en la región Andina del país tienen una elevada carga financiera atribuible al cuidado de una persona con enfermedad crónica.

Objective: To describe and analyze the financial burden of family care of the chronically ill in the Colombian Andean region. Materials and methods: This study is part of the Program for the Reduction of the burden of chronic disease in Colombia. The sample included 92 families residing in the Colombian Andean region. The Instruments "GCPC-UN- D" were used to characterize the subjects and the Survey Financial cost of chronic disease care of Montoya et al, to identify the real effective household consumption. The financial burden attributable to family care was determined under the Caracol methodology. Results: Costs that most afflict families of the Colombian Andean Region are in their order health, transportation, housing, food and communications. Family caring for a person with chronic illness affects its effective household consumption. Discussion: Colombian families residing in the Andean region of the country have a high financial burden attributable to caring for a person with chronic disease.

Introdução: Descrever e analisar a carga financeira do cuidado familiar do doente crónico na Região Andina da Colômbia. Materiais e métodos: Estudo que faz parte do Programa para a diminuição da carga da doença crónica na Colômbia. A sua amostra a constituíram 92 famílias que residem na região Andina da Colômbia. Se empregaram os instrumentos "GCPC-UN- D" para caracterizar aos sujeitos e o Questionário "Custo financeiro do cuidado da Doença crónica" para conhecer o consumo real efetivo familiar. A carga financeira atribuível ao cuidado familiar se determinou sob a metodologia caracol. Resultados: os custos que mais afligem às famílias da Região Andina colombiana são em sua ordem, os de saúde, transporte, vivenda, alimentação e comunicações. O consumo real efetivo familiar se modifica ao cuidar a uma pessoa com doença crónica. Discussão: as famílias colombianas que residem na região Andina do País têm uma elevada carga financeira atribuível ao cuidado de uma pessoa com doença crónica na Colômbia.

Incidencia de cáncer infantil en una ciudad colombiana / Incidence of Pediatric Cancer in a Colombian City / Incidência de cancro infantil em uma cidade colombiana

Introducción: el cáncer infantil es poco frecuente y solo representa entre el 0,5% y el 3% de las neoplasias malignas en el mundo. El objetivo de este estudio fue describir el comportamiento del número de casos de cáncer infantil en las comunas de Santiago de Cali entre el periodo 2009 al 2013. Materiales y métodos: se presentan los mapas con la distribución de las tasas de incidencia estandarizadas por edad para cada comuna y se propone una metodología estadística alternativa para obtener probabilidades predictivas de observar cantidades iguales o mayores de casos de cáncer infantil en un periodo igual al del estudio, utilizando técnicas propias de la Estadística Bayesiana. Resultados: en el periodo bajo estudio se observaron 350 casos de cáncer infantil en la ciudad (37% de leucemias), lo que corresponde a una incidencia estandarizada media de 121 casos nuevos por millón de individuos con edades menores de 15 años. Conclusión: las tasas de incidencia de cáncer infantil observadas para la ciudad fueron menores a muchas de las reportadas en la literatura, sin embargo, debe considerarse el hecho de que todos los estudios no comparten las mismas condiciones para la recolección de los datos en términos de tiempo y la definición de población infantil.

Introduction: Pediatric cancer is a rare disease and only represents between 0.5% and 3% of malignant neoplasms in the world. The main goal of this study was to describe the behavior of incidence of pediatric cancer in the administrative units of the urban area of Santiago de Cali in the period 2009 to 2013. Materials and methods: Maps with the distribution of standardized incidence rates by age for each administrative unit are presented. We propose a methodology to obtain the predictive statistical probabilities of observing equal or greater amounts of pediatric cancer cases in a time period equal to the study, using Bayesian statistical techniques. Results: During the period of study, were observed 350 cases of pediatric cancer in the city (37% of leukemia), corresponding to standardized incidence of new 121 cases per million of individuals aged under 15 years. Conclusion: Incidence rates of pediatric cancer observed for the city were lower than many of those reported in the literature, however, should be considered the fact that all studies do not share the same conditions for data collection in terms of periods time and the definition of child population.

Introdução: O cancro infantil é pouco frequente e só representa entre o 0,5% e o 3% das neoplasias malignas no mundo. O objetivo deste estudo foi descobrir o comportamento de número de casos de cancro infantil nas comunas de Santiago de Cali entre o período 2009 ao 2013. Materiais e métodos: apresentam-se os mapas com a distribuição das taxas de incidência estandardizadas por idade para cada comuna e se propõe uma metodologia estatística alternativa para obter probabilidades preditivas de observar quantidades iguais ou maiores de casos de cancro infantil em um período de tempo igual ao do estudo, utilizando técnicas próprias da Estatística Bayesiana. Resultados: no período sob estudo se observaram 350 casos de cancro infantil na cidade (37% de leucemias), o que corresponde a uma incidência estandardizada média de 121 casos novos por milhão de indivíduos com idades menores de 15 anos. Conclusão: as taxas de incidência de cancro infantil observadas para a cidade foram menores a muitas das reportadas na literatura, no entanto, deve considerar-se o fato de que todos os estudos não partilham as mesmas condições para a recoleção dos dados em termos dos períodos de tempo e a definição de população infantil.

Parâmetros e ganhos genéticos em características de crescimento de bovinos Tabapuã da Bahia / Parameters and gains in genetic characteristics of Bahia Tabapuã bovine Growth

Compararam-se dois modelos (com ou sem o efeito materno) na estimativa de parâmetros genéticos por meio do fator de Bayes (FB) e do critério de informação da deviance (DIC). Adicionalmente, avaliaram-se as tendências genéticas, maternas e fenotípicas em características de crescimento de bovinos da raça Tabapuã do estado da Bahia. O modelo que incluiu o efeito materno proporcionou menores valores de FB (167629,2; 117341,2 e 124804,8) e DIC (174550,0; 120242,7 e 128037,2) para pesos aos 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, respectivamente. As estimativas médias, a posteriori, das herdabilidades diretas e maternas foram 0,33; 0,43 e 0,44 e 0,15; 0,14 e 0,16 para as três características, respectivamente. As tendências genéticas para o efeito direto foram de 0,4415 e 0,3613kg/ano para P205 e P365 e representam incrementos de apenas 0,25 e 0,15% nas médias das características ao ano. As tendências genéticas maternas para as três características demonstraram perdas e indicam ausência de seleção de matrizes para boa habilidade materna. Apesar de existir variabilidade genética suficiente para justificar ganhos genéticos via seleção, estes e os ganhos fenotípicos foram pequenos, sugerindo necessidade de melhorias genéticas e ambientais.(AU)

We compared two models (with or without maternal effect) in the estimation of genetic parameters through Bayes Factor (BF) and the Deviance Information Criterion (DIC). Additionally, we evaluated the genetic, maternal and phenotypic trends in Tabapuã bovine growth characteristics in the state of Bahia. The model that included the maternal effect provided smaller BF values (167,629.2; 117,341.2 and 124,804.8) and DIC (174,550.0; 120,242.7 and 128,037.2) for weights at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age, respectively. The average estimates, a posteriori, the direct and maternal heritability (0.33, 0.43 and 0.44) and (0.15, 0.14 and 0.16) for the three characteristics, respectively. Genetic trends for direct effect were 0.4415 and 0.3613kg/year for W205 and W365 and presented increases of 0.25 and 0.15% in the average characteristics of the year. The phenotypic trend for W205 was 0.7039kg/year. Maternal genetic trends for the three characteristics showed losses and indicate absence of selection matrices for good maternal ability. Despite the magnitude of the estimated direct and maternal heritability, they indicate genetic gain opportunities, genetic and phenotypic trends indicated few direct gains and no gains for maternal ability.(AU)

Selectivity curves of the capture of mangrove crab (Ucides cordatus) on the northern coast of Brazil using bayesian inference / Curvas de seletividade da captura do caranguejo-uçá (Ucides cordatus) na costa norte do Brasil usando a inferência bayesiana

Abstract Fishing selectivity of the mangrove crab Ucides cordatus in the north coast of Brazil can be defined as the fisherman's ability to capture and select individuals from a certain size or sex (or a combination of these factors) which suggests an empirical selectivity. Considering this hypothesis, we calculated the selectivity curves for males and females crabs using the logit function of the logistic model in the formulation. The Bayesian inference consisted of obtaining the posterior distribution by applying the Markov chain Monte Carlo (MCMC) method to software R using the OpenBUGS, BRugs, and R2WinBUGS libraries. The estimated results of width average carapace selection for males and females compared with previous studies reporting the average width of the carapace of sexual maturity allow us to confirm the hypothesis that most mature individuals do not suffer from fishing pressure; thus, ensuring their sustainability.

Resumo A seletividade na pesca do caranguejo-uçá, na costa norte do Brasil, pode ser definida como a habilidade do pescador em capturar e selecionar indivíduos a partir de certo tamanho ou determinado sexo (ou pela combinação destes fatores) o que sugere uma seletividade empírica. Considerando esta hipótese foram calculadas as curvas de seletividade para caranguejos machos e fêmeas utilizando-se a função logit na formulação do modelo logístico. A inferência Bayesiana consistiu em obter a distribuição posterior com aplicação do método Monte Carlo com Cadeias de Markov - MCMC no software R com o uso do OpenBUGS e auxílio das bibliotecas BRugs e R2WinBUGS. Os resultados estimados de largura da carapaça média de seleção para machos e fêmeas comparados com estudos anteriores que relatam a largura da carapaça média de primeira maturação sexual permitem confirmar a hipótese de que grande parte dos indivíduos maduros não sofre a pressão da pesca o que garante sua sustentabilidade.

Associação genética entre ocorrência de mastite clínica e produção de leite em vacas Holandesas / Genetic association between clinical mastitis occurrence and milk yield in Holstein cows

RESUMO:O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos para ocorrência da mastite clínica (MC) e para a produção de leite acumulada até 305 dias (PR305) e estudar as associações genéticas entre elas, usando informações de 11.738 lactações de 5.084 vacas de um rebanho da raça Holandesa, paridas entre 1995 a 2010. Os componentes de covariância foram obtidos por abordagem Bayesiana, sob modelo animal. As estimativas de herdabilidade para a PR305 e para a MC foram de 0,16 (0,02) e 0,11 (0,02), respectivamente, e as repetibilidades foram 0,34 (0,012) e 0,21 (0,02), para PR305 e MC, respectivamente. A correlação genética entre a PR305 e a MC foi negativa e de baixa magnitude (-0,21±0,13). As estimativas de herdabilidade para PR305 e MC indicam que estas características são influenciadas por fatores ambientais, entretanto há suficiente variabilidade genética para obtenção de ganhos através da seleção.

ABSTRACT:The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for the occurrence of clinical mastitis (MC) and milk production during lactation (PR305) and study the genetic associations between them, using information from 11,738 lactations of 5,084 Holstein herd cows, that calved from 1995 to 2010. The covariance components were estimated by Bayesian inference using the animal model. Heritability estimates for the PR305 and the MC were 0.16 (0.02) and 0.11 (0.02), respectively and repeatability were 0.34 (0.012) for PR305 and 0.21 (0.02) for MC. The genetic correlation between the PR305 and the MC was negative and of low magnitude (-0.21±0.13). Heritability estimates for PR305 and MC indicate that these characteristics are influenced by environmental factors, however there is enough genetic variability to obtain gains through selection.

Parâmetros genéticos para características produtivas e biométricas em abelha Melipona quadrifasciata anthidioides LEPELETIER / Genetic parameters for production and biometrics traits in honey bee Melipona quadrifasciata anthidioides LEPELETIER

Os objetivos deste trabalho foram estimar componentes de variância genética aditiva, fenotípica e residual e a herdabilidade para características relacionadas com a produção de mel e com a estrutura do ninho de abelhas Melipona quadrifasciata anthidioides. Sessenta colônias de diferentes regiões da Bahia foram transladadas para caixas padronizadas modelo INPA e divididas, originando as gerações parentais G1 e G2. Foram medidas as características: estimativa da produção de mel; número, largura, volume e altura dos potes de mel; número, altura e diâmetro dos potes de pólen; peso; número, largura e diâmetro dos discos de cria e estimativa da população da colônia. As medidas foram corrigidas para o efeito fixo de mês de mensuração. Os componentes de variância e herdabilidade foram estimados por meio do método de semelhança entre parentes, utilizando-se abordagem Bayesiana. As médias e os desvios padrão variaram de 2,01±0,70cm para diâmetro de potes de pólen a 2.333,0±384,1kg para o peso das caixas. Houve indicação de convergência para todas as cadeias obtidas. As estimativas de variância genética aditiva variaram de 0,02cm para as características largura dos potes de mel a 38.587,72kg para o peso. Para as estimativas de variâncias fenotípicas, os valores variaram de 0,05 para a altura dos potes de pólen a 95.136,43kg para o peso; e para as variâncias residuais, os valores encontrados variaram de 0,02 para a variável largura dos potes de mel a 56.548,71kg para o peso. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,35 a 0,53. Os resultados demonstraram que as características avaliadas possuem variação genética aditiva que garante boa resposta à seleção.

The aim of this study was to estimate components of genetic variance, phenotypic and residual and heritability for traits related to the production of honey and the nest structure of bee Melipona quadrifasciata anthidioides. Sixty colonies from different regions of Bahia were transferred to standard INPA model boxes and divided, creating the parental generations G1 and G2. The following characteristics were measured: estimated production of honey, number, width, height and volume of the honey pots, number, height and diameter of pollen storage pots, weight, number, length and diameter of the brood combs and estimate the population of the colony. The measurements were corrected for the fixed effects of month of measurement. The variance components and heritability were estimated by the method of similarity between relatives using the Bayesian approach. The mean and standard deviations ranged from 2.01±0.70cm diameter pots for pollen to 2333.0±384.1kg to the weight of the boxes. There was indication of convergence for all the chains obtained. Estimates of the additive genetic variance ranged from 0.02cm to the width characteristics of honey pots to 38587.72kg for weight. For the estimates of phenotypic variance the values ranged from 0.05 for the height of the pollen pots to 95136.43kg for weight; and the residual variance the values varied from 0.02 for the variable width of the honey pots to 56548.71kg for weight. The results showed that the characteristics assessed have additive genetic variation that ensures good response to selection.

Inferencia bayesiana e investigación en salud: un caso de aplicación en diagnóstico clínico / Bayesian inference and health research studies: an application case in clinical diagnosis

Introducción: Los métodos propios de la inferencia estadística bayesiana son una alternativa bastante útil y confiable para realizar los análisis de datos recogidos dentro de los proyectos de investigación en las diferentes áreas de la salud. Una de las aplicaciones más comunes se da en los estudios de validación de pruebas para diagnóstico clínico, en los que el uso del teorema de Bayes para la obtención de los valores predictivos de la prueba en evaluación es el procedimiento natural. Materiales y métodos: Se desarrolló un procedimiento para estimar la sensibilidad y la especificidad de la colangioresonancia magnética como prueba tamiz para clasificar individuos con coledocolitiasis.El análisis de datos incluyó obtener los indicadores de desempeño de la colangioresonancia utilizando metodología bayesiana tanto en el caso discreto como en el caso continuo. Resultados: Tanto para la sensibilidad como para especificidad, las estimaciones bayesianas presentaron un mayor grado de precisión frente a las estimaciones obtenidas mediante el método clásico de máxima verosimilitud. Conclusión: los métodos bayesianos son bastante útiles en situaciones como la tratada en este artículo en la que los tamaños de muestra para obtener las estimaciones pueden considerarse muy “pequeños” lo cual hace que las estimaciones usando métodos no bayesianos no sean tan confiables debido a su poca precisión.

Introduction: the bayesian methods are a helpful and reliable alternative to analyze the data obtained in research Projects within the health sciences. One of the most common applications is given in the clinical diagnostic tests validation studies, in which the use of Bayes’ theorem to obtain predictive values of the test under evaluation is the natural choise. Material y methods: A method to estimate the sensitivity and specificity of magnetic resonance cholangiography as a screening test to classify individuals with choledocholithiasis was developed. The estimation process was developed using the Bayesian methodology. Results: The Bayesian estimates of the sensitivity and specificity had a greater degree of accuracy compared to the estimates obtained by the classical method of maximum likelihood. Conclusion: Bayesian methods are quite useful in situations such as discussed in this article that the sample sizes for the estimates can be considered very “small”. In those situations the results obtained using non Bayesian methods may be more inaccurate and unreliable.

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.

Aspectos ambientais e genéticos da prolificidade em caprinos utilizando modelos bayesianos de limiar e linear / Environmental and genetic aspects of litter size in goats using linear and threshold bayesian models

Foram estimados os componentes de variância e os parâmetros genéticos da característica prolificidade, utilizando-se inferência bayesiana sob modelo animal linear e de limiar. A prolificidade de cabras mestiças foi estudada com informações referentes ao período de oito anos consecutivos. As análises foram realizadas com cadeias de 500.000 ciclos. Considerou-se burn-in dos 15.000 valores iniciais, sendo tomados valores a cada 250 ciclos, para se obter a distribuição a posteriori com 1.940 amostras. Os efeitos do mês de cobrição e da ordem de parto e o efeito linear do peso à cobrição foram significativos. As herdabilidades foram de 0,03 e 0,18 para o modelo linear e o modelo de limiar, respectivamente. O uso do modelo de limiar mostrou-se adequado, produzindo estimativas superiores acerca dos parâmetros estimados.

Variance components and genetic parameters of the litter size trait, using Bayesian inference under linear and threshold animal model were estimated. The litter size of crossbred goats was studied with information regarding a period of eight consecutive years. Analyses were performed with 500,000 cycle chains. The burn-in of the 15,000 baseline values was considered and these were taken every 250 cycles to obtain a posteriori distribution with 1,940 effective samples. Statistical analyses showed that the effects of coverage month, delivery order and linear effect of weight on coverage were significant. The heritabilities were 0.03 and 0.18 for linear and threshold models respectively. The threshold model proved to be suitable, producing higher estimates regarding the estimated parameters.

Optimized Detection of the Infrequent Response in P300-Based Brain-Computer Interfaces / Detección optimizada de la respuesta infrecuente en interfaces cerebro-computadora

This paper presents an application developed on the BCI2000 platform which reduces the average spelling time per symbol on the Donchin speller. The motivation was to reduce the compromise between spelling rate and spelling accuracy due to the large amount of responses required in order to perform coherent average techniques. The methodology was made under a Bayesian approach which allows calculation of each target's class posterior probability. This result indicates the probability of each response of belonging to the infrequent class. When there is enough evidence to make a decision the system stops the stimulation process and moves on with the next symbol, otherwise it continues stimulating the user until it finds the selected letter. The average spelling rate, after using the proposed methodology with 14 healthy users and a maximum number of 5 stimulation sequences, was of 6.1 ± 0.63 char/min, compared to a constant rate of 3.93 char/min with the standard system.

Este trabajo presenta una aplicación desarrollada sobre la plataforma BCI2000 que disminuye el tiempo promedio de selección de los símbolos del deletreador de Donchin. La motivación consistió en reducir el compromiso entre la taza de deletreo y la precisión correspondiente, la cual surge como consecuencia de la gran cantidad de respuestas necesarias para realizar técnicas de promediación coherente. La metodología propuesta se basa en un enfoque Bayesiano que permite calcular la probabilidad posterior asociada con la clasificación de cada objetivo, resultado que indica la evidencia que presentan las respuestas de pertenecer a la clase infrecuente. Cuando existe evidencia suficiente para tomar una decisión, el sistema detiene el proceso de estimulación y continúa con el siguiente símbolo, de lo contrario permanece estimulando al usuario hasta conseguir identificar la letra seleccionada. Después de utilizar la metodología propuesta sobre los registros de 14 usuarios sanos con un número máximo de 5 series de estimulación, el tiempo promedio de deletreo reportado es de 6.1 ± 0.63 letras/min, el cual es comparado con una taza constante de 3.93 letras/min obtenido con un sistema convencional.

Modelagem da dinâmica espaço-temporal da abundância do Aedes aegypti, obtida com armadilhas de captura de mosquitos adultos / Modeling the spatiotemporal dynamics of abundance of Aedes aegypti, obtained with traps capture adult mosquitoes

A heterogeneidade temporal e espacial da incidência da dengue reflete a complexidade de fatores de risco envolvidos na transmissão, e em particular, da dinâmica do principal vetor no Brasil, o mosquito Aedes aegypti. Neste estudo foram analisados dados de 425 armadilhas de fêmeas grávidas (Mosqui-TRAPs), georreferenciadas e monitoradas ao longo de 90 semanas, no município de Governador Valadares (MG). Os efeitos de variáveis climáticas, socioambientais, demográficas e de índices larvários foram analisados através de modelos lineares e não-lineares no espaço e/ou tempo, utilizando métodos estatísticos clássicos e bayesianos. Temperatura mínima defasada de 4 semanas e umidade mínima desafada de 2 semanas foram os melhores preditores da abundância e a população de mosquitos cresceu para valores acima de 18 C de temperatura e de 54% de umidade. Através da análise wavelet identificaram se efeitos locais não-estacionários das variáveis meteorológicas ao longo do período de tempo observado. Os modelos espaciais e espaço-temporais permitiram identificar áreas com alta abundância de mosquitos que poderiam ser alvos primários de ações de controle do vetor. Omodelo espacial considerou o efeito espacialmente estruturado da localização das armadilhas,além das covariáveis. Os depósitos tais como vasos e pratos de plantas com água, garrafas retornáveis,materiais de construção, calhas, ralos, e piscinas não tratadas foram predominantes. Os modelos não detectaram aglomerados espaciais de alta abundância do mosquito, identificando apenas locais isolados de alta infestação no munícípio. Este resultado fornece evidências de que ações de controle deveriam ser realizadas ao nível de domicílios, ou pelo menos, numa escala menor que 200-250 metros, durante os meses com temperaturas mais baixas.O entendimento da distribuição espacial e/ou temporal da abundância do mosquito pode contribuir de forma significativa para a elaboração de ações que busquem evitar a proliferação do vetor, através de campanhas direcionadas para as áreas de maior infestação, bem com opriorizar épocas do ano em que a abundância seja diferencial.

Modelos Bayesianos de inferencia psicológica: ¿cómo predecir acciones en situaciones de incertidumbre? / Bayesian models of psychological inference: how to predict actions under uncertainty situations?

Esta investigación examinó si la capacidad para predecir acciones en circunstancias de incertidumbre puede ser comprendida como un proceso de inferencia bayesiana. Se llevaron a cabo dos experimentos, cada uno con un grupo diferente de estudiantes universitarios del ciclo básico. En ambos experimentos, se presentó un video en donde un agente entraba a un laberinto para consumir alimento. La tarea de los participantes fue predecir cuál de cuatro entradas utilizaría el agente para ingresar a la parte interna del laberinto. Los resultados mostraron una correlación alta, significativa a un p< 0.01, entre las predicciones del modelo bayesiano y las respuestas de los participantes. Este hallazgo revela que la capacidad de predecir acciones implica la estimación de la probabilidad posterior, de acuerdo con el modelo bayesiano propuesto.

This study investigated if capacity for predicting actions under uncertainty conditions can be understood like a Bayesian inferential processes. Two experiments were carried out, each one with a different group of basic cycle undergraduate students. In both experiments it was presented a film that showed an agent getting into mace for eating meal. Participants had to predict which of four entrances would use the agent for getting inside of the mace. Results showed a high correlation, significant to a p< 0.01, between predictions of a Bayesian inferential model and the answers of the participants. Findings reveal that capacity for predicting actions involve estimations of posterior probability in accordance with the Bayesian model proposed.

Análise bayesiana para modelos de degradabilidade ruminal / Bayesian analisys for ruminal degradability models

Neste estudo, utilizou-se a metodologia bayesiana para ajustar os modelos de ORSKOV & MCDONALD (1979) e MCDONALD (1981) a conjuntos de dados simulados e a um conjunto de dados de porcentagem de degradação da fibra em detergente neutro da gramínea coastcross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis), ao longo do tempo. As amostras das distribuições marginais a posteriori dos parâmetros foram obtidas por meio dos métodos de Monte Carlo com cadeias de Markov (MCMC), especificamente, os algoritmos Amostrador de Gibbs e Metropolis-Hastings. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente, sendo avaliada e comprovada pelo estudo de simulação, que apresentou estimativas bem próximas ao valor paramétrico. As estimativas obtidas para os parâmetros dos modelos por meio da abordagem bayesiana mostraram-se bastante coerentes com os valores relatados na literatura. O modelo de Orskov e McDonald foi mais plausível que o modelo de McDonald na descrição dos dados de degradação.

The bayesian methodology was used to estimate the parameters of ORSKOV & MCDONALD (1979) and MCDONALD (1981) models. A study was conducted by using both simulated and real data percentage of coastcross grass (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis) fiber degradation with neutral detergent fiber degradation over the time. The posterior marginal samples distributions for the parameters were obtained by Gibbs Sampler and Metropolis-Hastings algorithms. The bayesian approach, evaluated and verified by the simulation studied, has proved to be efficient and the parameter estimated were quite close to the parametric values. The parameters estimated for both models using bayesian approach from real data were fairly consistent with the values reported in the literature. The Orskov and McDonald model was more plausible than the description degradation data made by the McDonald model.

Phylogenetic relationships between Bacillus species and related genera inferred from 16s rDNA sequences / Relações filogenéticas entre espécies de Bacillus e gêneros relacionados baseadas em sequencias 16S rDNA

Neigh-borjoining, maximum-parsimony, minimum-evolution, maximum-likelihood and Bayesian trees constructed based on 16S rDNA sequences of 181 type strains of Bacillus species and related taxa manifested nine phylogenetic groups. The phylogenetic analysis showed that Bacillus was not a monophyletic group. B. subtilis was in Group 1. Group 4, 6 and 8 respectively consisted of thermophiles, halophilic or halotolerant bacilli and alkaliphilic bacilli. Group 2, 4 and 8 consisting of Bacillus species and related genera demonstrated that the current taxonomic system did not agree well with the 16S rDNA evolutionary trees. The position of Caryophanaceae and Planococcaceae in Group 2 suggested that they might be transferred into Bacillaceae, and the heterogeneity of Group 2 implied that some Bacillus species in it might belong to several new genera. Group 9 was mainly comprised of the genera (excluding Bacillus) of Bacillaceae, so some Bacillus species in Group 9: B. salarius, B. qingdaonensis and B. thermcloacae might not belong to Bacillus. Four Bacillus species, B. schlegelii, B. tusciae, B. edaphicus and B. mucilaginosus were clearly placed outside the nine groups.

Árvores utilizando os métodos de neighbor-joining, máxima parcimônia, evolução mínima, máxima verossimilhança e bayesiana, construídas baseadas em seqüências de rDNA 16S de 181 linhagens-tipo de espécies de Bacillus e taxa relacionados, mostraram a formação de nove grupos filogenéticos. A análise filogenética mostrou que Bacillus não é um grupo monofilético. B. subtilis se colocou no Grupo 1. Grupos 4, 6 e 8, respectivamente, consistiram de bacilos termofílicos, halofílicos ou halotolerantes e alcalifílicos. Grupos 2, 4 e 8 consistindo de espécies de Bacillus e gêneros relacionados demonstraram que o sistema taxonômico corrente não concorda perfeitamente com as árvores evolucionárias por rDNA 16S. A posição de Caryophanaceae e Planococcaceae no Grupo 2 sugere que estes podem ser transferidos para Bacillaceae, e a heterogeneidade do Grupo 2 implica em que algumas espécies de Bacillus neste grupo podem pertencer a vários novos gêneros. O Grupo 9 foi principalmente composto de gêneros de Bacillaceae (excluindo Bacillus), portanto algumas espécies de Bacillus no Grupo 9: B. salarius, B. qingdaonensis e B. thermcloacae podem não pertencer a Bacillus. Quatro espécies de Bacillus, B. schlegelii, B. tusciae, B. edaphicus e B. mucilaginosus foram claramente colocadas fora dos nove grupos.

Phylogenetic relationships between Bacillus species and related genera inferred from 16s rDNA sequences

Neigh-borjoining, maximum-parsimony, minimum-evolution, maximum-likelihood and Bayesian trees constructed based on 16S rDNA sequences of 181 type strains of Bacillus species and related taxa manifested nine phylogenetic groups. The phylogenetic analysis showed that Bacillus was not a monophyletic group. B. subtilis was in Group 1. Group 4, 6 and 8 respectively consisted of thermophiles, halophilic or halotolerant bacilli and alkaliphilic bacilli. Group 2, 4 and 8 consisting of Bacillus species and related genera demonstrated that the current taxonomic system did not agree well with the 16S rDNA evolutionary trees. The position of Caryophanaceae and Planococcaceae in Group 2 suggested that they might be transferred into Bacillaceae, and the heterogeneity of Group 2 implied that some Bacillus species in it might belong to several new genera. Group 9 was mainly comprised of the genera (excluding Bacillus) of Bacillaceae, so some Bacillus species in Group 9: B. salarius, B. qingdaonensis and B. thermcloacae might not belong to Bacillus. Four Bacillus species, B. schlegelii, B. tusciae, B. edaphicus and B. mucilaginosus were clearly placed outside the nine groups.

Árvores utilizando os métodos de neighbor-joining, máxima parcimônia, evolução mínima, máxima verossimilhança e bayesiana, construídas baseadas em seqüências de rDNA 16S de 181 linhagens-tipo de espécies de Bacillus e taxa relacionados, mostraram a formação de nove grupos filogenéticos. A análise filogenética mostrou que Bacillus não é um grupo monofilético. B. subtilis se colocou no Grupo 1. Grupos 4, 6 e 8, respectivamente, consistiram de bacilos termofílicos, halofílicos ou halotolerantes e alcalifílicos. Grupos 2, 4 e 8 consistindo de espécies de Bacillus e gêneros relacionados demonstraram que o sistema taxonômico corrente não concorda perfeitamente com as árvores evolucionárias por rDNA 16S. A posição de Caryophanaceae e Planococcaceae no Grupo 2 sugere que estes podem ser transferidos para Bacillaceae, e a heterogeneidade do Grupo 2 implica em que algumas espécies de Bacillus neste grupo podem pertencer a vários novos gêneros. O Grupo 9 foi principalmente composto de gêneros de Bacillaceae (excluindo Bacillus), portanto algumas espécies de Bacillus no Grupo 9: B. salarius, B. qingdaonensis e B. thermcloacae podem não pertencer a Bacillus. Quatro espécies de Bacillus, B. schlegelii, B. tusciae, B. edaphicus e B. mucilaginosus foram claramente colocadas fora dos nove grupos.

Análise Bayesiana no estudo do tempo de retorno das precipitações pluviais máximas em Jaboticabal (SP) / Bayesian analysis for estimating the return period of maximum precipitation at Jaboticabal São Paulo state, Brazil

Dados históricos de precipitação máxima são utilizados para realizar previsões de chuvas extremas, cujo conhecimento é de grande importância na elaboração de projetos agrícolas e de engenharia hidráulica. A distribuição generalizada de valores extremos (GEV) tem sido aplicada com freqüência nesses tipos de estudos, porém, algumas dificuldades na obtenção de estimativas confiáveis sobre alguma medida dos dados têm ocorrido devido ao fato de que, na maioria das situações, tem-se uma quantidade escassa de dados. Uma alternativa para obter melhorias na qualidade das estimativas seria utilizar informações dos especialistas de determinada área em estudo. Sendo assim, objetiva-se neste trabalho analisar a aplicação da Inferência Bayesiana com uma distribuição a priori baseada em quantis extremos, que facilite a incorporação dos conhecimentos fornecidos por especialistas, para obter as estimativas de precipitação máxima para os tempos de retorno de 10 e 20 anos e seus respectivos limites superiores de 95 por cento, para o período anual e para os meses da estação chuvosa em Jaboticabal (SP). A técnica Monte Carlo, via Cadeias de Markov (MCMC), foi empregada para inferência a posteriori de cada parâmetro. A metodologia Bayesiana apresentou resultados mais acurados e precisos, tanto na estimação dos parâmetros da distribuição GEV, como na obtenção dos valores de precipitação máxima provável para a região de Jaboticabal, apresentando-se como uma boa alternativa na incorporação de conhecimentos a priori no estudo de dados extremos.

Historical maximum rainfall data are used to forecast extreme rainfall, which is important to elaborate agricultural and hydraulic engineering projects. Generalized Extreme Value Distribution (GEV) has been applied in such type of studies. Since those values are extracted from the upper (or lower) tail of the original distribution, a scarce amount of data is obtained in most cases, which may be a problem acquiring reliable estimates about some measure of interest. An alternative to overcome this potential problem would be the use of information available from experts in the area. Therefore, this paper intended to analyze the application of the Bayesian Inference using a priori distribution based on extreme quantiles, which facilitates the incorporation of the information supplied by the experts in order to determine the punctual and the 95 percent upper limit estimates of the probable maximum precipitation for return periods of 10 and 20 years, yearly and monthly in Jaboticabal, São Paulo State, Brazil. Markov Chain Monte Carlo (MCMC) methods were used to a posterior inference of each parameter. Bayesian inference yielded more suitable and accurate results in the estimation of the parameters of the GEV distribution as well as in the determination of the values of the probable maximum precipitation estimates for Jaboticabal. It turned out as an interesting way of incorporating prior knowledge to the study of extreme data.